天下第一医师徐长灯坠崖身亡，其女徐悠然前去投靠瑞王爷，不想路上遭侍女毒手并失忆，而侍女青露则趁机冒充前往瑞王府想要成为世子妃。让人没想到的是，如今在悠然身体里的，是曾震慑江湖的毒医妖女，乐千秋的灵魂。毒医重生，曾经掀起血雨腥风的她，该如何度过这一世呢？

风起云涌，宦官弄权的明朝末期，忠臣左光斗因弹劾奸佞魏忠贤而招致杀身之祸，满门惨死于东厂的黑暗权势之下。其女左清菡怀揣奸党贪赃枉法的证据“忠蠹名册”被锦衣卫百户方涂山所救，二人在逃避东厂追杀时，幸得路过的明教五行旗总掌旗使大邱出手相助，受伤落魄的他们由此被带入与世隔绝的桃源村。朝廷一面，东厂左右千户仇士海、狄耕为了争夺东厂督主之位明争暗斗；另一面，桃源村地处偏僻，村民均为明教教徒，虽被朝廷解散却始终奉行除恶扬善教义的明教教徒们，对突然闯入的二人抱有很大的敌意，大家开始因担心陌生人的到来可能给村子带来祸患而想